ก่อนการผ่าตัดแปลงเพศนั้น แน่นอนว่าจะต้องมีการเตรียมก่อนที่จะเข้าทำการผ่าตัดแปลงเพศ การตั้งเนื้อตัวตัวก่อนผ่าตัดแปลงเพศ มีเหตุฉะนี้
1.งดน้ำพร้อมด้วยอาหารการกินตามแพทย์สั่ง 8 ชั่วโมง ก่อนการผ่าตัดแปลงเพศ
2.ควรพักให้เพียงพอก่อนการผ่าตัดแปลงเพศ
3.หยุดใช้ยาฮอร์โมน 4 สัปดาห์ ก่อนการผ่าตัด ทุกชนิด
4.ในกรณีที่มีโรคประจำตัวที่ต้องทานยาเป็นนิตย์ ให้แจ้งไวทย์ในวันที่นัดหารือ เพราะยาบางชนิดอาจต้องแจ้งให้วิสัญญีคุณหมอทราบก่อนการผ่าตัด
5.ยาที่สั่งสอนให้หยุดทานก่อนการผ่าตัด 2 สัปดาห์ ได้แก่ ยากลุ่ม แอสไพรินหรือบลูเฟน วิตามินอี สมุนไพรบางกลุ่ม เช่น กระเทียม ใบแปะก๊วย เหตุเพราะยากับสมุนไพรดังกล่าวข้างต้นมีผลทำให้เลือดออกง่าย
6.ควรงดสูบบุหรี่ พร้อมกับดื่มแอลกอฮอล์ ก่อนผ่าตัด 4-6 อาทิตย์
7.ควรลาหยุดงาน 3-4 อาทิตย์ เพื่อเพื่อการผ่าตัด และการพักฟื้นหลังผ่าตัด
8.ควรมีญาติมาด้วยในวันผ่าตัด เพราะ 1-2 วันแรกจะไม่สามารถทะนุถนอมตัวเองได้ดี พร้อมด้วยไม่ควรขับรถมาเองในวันผ่าตัด
9.ควรสรงน้ำชำระล้างร่างกายก่อนผ่าตัด เหตุเพราะหลังผ่าตัดจะไม่สามารถรดน้ำได้คาด 6 วัน
10.ไม่ควรนำของใช้มีค่าประจำตัวมาในวันผ่าตัด
11.นำคู่มือที่ชอบอ่าน หรือ DVD ที่ชอบดู เตรียมไปที่โรงหมอ เพื่อใช้ในช่วงหลังผ่าตัดวันที่ 3 และ 4
12.เตรียมอาภรณ์ที่ใส่หลังผ่าตัด ควรเตรียมกระโปรงหลวมๆ ไม่ควรใส่กางเกงเพราะจะทำให้เจ็บแผลเป็น
13.ในกรณีที่ผล HIV เป็นบวก อาจต้องตรวจ CD4 ถ้าอยู่ในเกณฑ์ปกติ จะสามารถทำการผ่าตัดได้ แต่ถ้ามีค่า CD4 ลดลงทุกที ควรทำการรักษาโรค HIV ก่อน จนค่า CD4 ปกติดี ผู้ที่มีผลโลหิตเป็นบวก จะมีค่าใช้จ่ายยิ่งขึ้นประมาณ 100 %
14.ในวันก่อนผ่าตัดถ้าเป็นไข้หวัด หรือไม่สบายควรเลื่อนการผ่าตัดไปก่อน
15.ถ้ามีโรคติดเชื้อทางการร่วมเพศอื่น เช่น หูดหงอนไก่ เริม แผลริมอ่อน ควรป้องกันให้หายก่อนนัดผ่าตัด เนื่องด้วยหลังผ่าตัดการดูแลรักษาการติดโรคทำได้เลว